企業的各職能部門因所處地（dì）位（wèi）、戰（zhàn）略目標、主要任務、承擔（dān）職（zhí）責（zé）、思考角度等各方（fāng）麵（miàn）的不同，因而製定的職能戰略會出現一定（dìng）程度的矛盾和（hé）差異。例如，在庫存方（fāng）麵，市場營銷部門希望產成品的庫存量多一些，以便隨時滿足客戶需求，而財務部門則希望庫存（cún）少一些（xiē），以（yǐ）便降低庫存成本和資金占用；在產品生產方麵，市場（chǎng）營銷部門希（xī）望產品的花（huā）色（sè）品種齊全，滿足不同客戶的不同（tóng）需求，而生產部門則主要考慮如（rú）何提高產品質量、降低成本（běn），從而寧願組織大批量生（shēng）產或成（chéng）批輪番生（shēng）產（chǎn）。這些差異反映到戰略上，就會導致職（zhí）能戰略矛盾。
職能部門和職能戰略之（zhī）間的協調（diào）對於企業戰略成敗與否是極其重要的。本節就介紹幾種協調職能戰（zhàn）略的（de）方法。
一、決策樹
美（měi）國教授霍福爾提出一種用於分析各職（zhí）能戰略相互依存（cún）關係的決策樹。決策樹從左上部開（kāi）始到右下部為止，列出（chū）所製（zhì）定的各種職能戰（zhàn）略的要點，並揭示各職（zhí）能係統之間的（de）內在聯係。利用決策樹製定各職能戰略，有助於（yú）實現各戰略的協調。
二、目標管理
目標是根據企業目的或宗旨而提出的在一定時期內要達到的預期成（chéng）果，是（shì）企業各項管理活動所指（zhǐ）向的（de）終點。目標和戰（zhàn）略是緊密相聯的——戰略就是規劃人（rén）力資源（yuán）和物力資源的使用方向，從而（ér）最大限度地實現目標。因此，通過（guò）運用目標管理法，有助（zhù）於各職能戰略之間的協調。
目標管理（，）是世紀年（nián）代中（zhōng）期出現於美國、以泰羅的科學管（guǎn）理（lǐ）和行為科學理論為基礎所形成的管理製度（dù）。在這種製度下，目標層層分解（jiě），層層落實（shí）。各經營領域根據企（qǐ）業總（zǒng）體戰略目標製定（dìng）經營領域戰略目標……這樣一（yī）直落實到（dào）崗位和（hé）個人。
在建立戰略目標體係的過程中，各層次、各方麵之間要相互磋商、相互（hù）平衡，以確保各層次戰略、各職能戰略之間（jiān）的協調。這樣，有利於保證各職能係統都保持相同的戰略（luè）方向，使（shǐ）其在製定（dìng）各自（zì）的職（zhí）能戰略時，能夠（gòu）從全局利益出發，謀求協調一致（zhì）。
三、激勵製度（dù）
各職能戰略之間的協調還有賴於激勵製度。企業在設計和實施激勵製度時，要注意避免（miǎn）鼓勵各職能領域的單獨（dú）工作績效，而應著重（chóng）獎勵職能部門之間的協（xié）調（diào）行為以及由此產生的成果。總（zǒng）之企業的激勵製度應與總體戰略（luè）相配合，鼓勵各職能部門協同一致地實現戰略目標。
四、管理能力
為了保持各職能戰略之間的協調，除了決策、製度等方麵的措施以外，還在於（yú）管理（lǐ）人員是否具有較高威望、較高的管（guǎn）理（lǐ）水平、較好的化解矛盾（dùn）和衝突的能力、吸引組織成員同心協力的感召力等等。
五、組織文化
如果企業擁有和諧融洽的文化氛圍，組織成員樹（shù）立起係統觀念、全局觀念、整體觀念，克（kè）服各種形式的本位主義、自由（yóu）主義，則有利於促進各職能戰略的協調。
總之，職能戰（zhàn）略的協調（diào）和協同效應是實現企業總體戰略和經營領域戰略、建立企業戰略優勢的重要保證。企業必須對（duì）此高度重視，並從決策方式、目標管理、激（jī）勵製（zhì）度、管理能力、組織文化等各方麵努力促（cù）進各職能戰略的協調（diào）。